1. Flora
La flora corresponde a la diversidad de especies de plantas de un territorio definido. La flora de la Isla del Coco tiene relación con las del territorio continental, especialmente con las de Centroamérica y las del norte de Sudamérica. Esta flora llegó a la ínsula por dispersión facilitada, por medio de aves visitantes, vientos, corrientes marinas y materiales flotantes.
El mayor porcentaje de especies vegetales de la Isla presenta afinidad con la flora de la provincia fitogeográfica guyano-amazónica de la región neotropical. Este hecho se explica por la llegada de propágulos (materiales reproductivos y vegetativos) a la Isla, procedentes del continente, lo cual ocurrió en algún momento durante el Plioceno-Pleistoceno, antes de que se cerrara el istmo centroamericano en el área de Panamá y cuando los aportes fluviales, incluyendo los de los ríos Magdalena y Orinoco, se vertían en un mar común, que tenía corrientes que circulaban hacia el oeste y que podían transportar elementos florísticos hasta la Isla del Coco.
Aunque la isla tiene una vegetación densa y exuberante, no contiene una gran diversidad de especies. Se han hallado alrededor de 135 especies de fanerógamas (plantas con flores y semillas), de las cuales dos tercios corresponden a dicotiledóneas y un tercio a monocotiledóneas, ambas con un 7,4 % de especies endémicas. Se han reportado 74 especies de helechos y afines, con un 6,6% de endemismo. La flora de hongos superiores es rica, considerando la pequeña superficie de la Isla. Se han encontrado 85 especies, aunque se estima que estas representan tan solo un 50% de las especies existentes. La flora de biófitas está compuesta, a la fecha, por 162 especies, de las cuales 56 son musgos y 106 hepáticas. Estas especies tienen afinidades neotropicales (54%), caribeñas (9,7%), pantropicales (10,4%), y presentan un 3,2% de endemismo. Para la Isla, se han identificado 99 líquenes foliícolos, los cuales tienen relaciones con floras pantropicales (61%), neotrópico-africanas (14%), neotrópico-autralasianas (4%), neotropicales (16%), autralasianas (1%), con un endemismo del 3%.
Por lo anterior, desde el punto de vista florístico, la Isla del Coco puede considerarse una unidad biogeográfica disjunta en el Pacífico Oriental Tropical. Constituye un verdadero jardín botánico de flora tropical que incluye elementos de diversas regiones fitogeográficas. El análisis del conocimiento actual sobre la diversidad de esa flora, de sus relaciones biogeográficas y de su endemismo, demuestra su excepcionalidad y su alto interés científico.
