La Isla del Coco es un territorio insular único y excepcional. Estas características están determinadas por una serie de condiciones relativas a su origen geológico, localización geográfica y su carácter de isla oceánica, que proporcionan una diversidad de ambientes naturales y una flora y fauna, marina y terrestre, excepcionales.

La Isla del Coco emerge como isla oceánica a partir de un fenómeno volcánico de la cordillera submarina que se desarrolla sobre la Placa de Cocos en el Pacífico Tropical Oriental, siendo el único territorio emergente de esa cordillera, y por consiguiente, punto clave para el estudio y monitoreo de fenómenos geológicos y de la tectónica de placas.

Las islas oceánicas son singulares y escasas en el mundo. Después de surgir en medio del océano, la Isla del Coco en sus comienzos estaba desprovista de vida. A causa de su lejanía de la tierra firme, su colonización por organismos continentales fue lenta y no uniforme. Se puede observar que en ella se instalaron grupos de organismos muy bien representados y otros menos o totalmente ausentes, lo que originó una biota (flora y fauna) pobre e inarmónica (disarmónica), pero excepcional en relación con las biotas continentales.

Una característica especial de las islas oceánicas, es la presencia de animales y plantas endémicas, es decir, organismos que solo se encuentran en ese lugar en el mundo, estos endemismos son producto de la evolución en territorios aislados y con la ausencia de flujos genéticos externos, especialmente continentales.

Otro rasgo distintivo de las islas oceánicas, como lo es la Isla del Coco, es que los procesos ecológicos y evolutivos se realizan en ecosistemas simplificados (con pocos organismos), lo cual permite que su estudio sea más simple y accesible para los investigadores.

La Isla del Coco ofrece otras dos características sobresalientes desde el punto de vista biológico y ecológico. La primera se refiere a la existencia de una importante diversidad de ambientes insulares, marinos y terrestres, en relación con su extensión o tamaño, lo que ha desarrollado una biota especial y singular a pesar de su limitada diversidad numérica.

La segunda característica se refiere al aislamiento geográfico de la Isla. Por ser el único punto emergente de la cordillera de Cocos en ese sector del Pacífico del Este, es punto de convergencia de especies marinas pelágicas migratorias, que llegan a sus aguas circundantes a completar algunas de las etapas de sus ciclos de vida (especialmente alimentación y reproducción). Esto la convierte en un sitio clave para el mantenimiento de las reservas de recursos marinos en la región, y en un lugar de mucha importancia para estudios de comportamiento, reproducción y dinámica de poblaciones de las especies marinas. El aislamiento geográfico también es una condición que permite los procesos de selección natural y evolución en su parte terrestre.

La Isla del Coco del Coco está localizada en el Pacífico Oriental Tropical, en una posición geográfica estratégica, única y excepcional, en relación con los fenómenos climáticos y oceanográficos que condicionan el medio ambiente regional y el de la propia isla.

Climatológicamente, esta Isla está situada en un punto por el que pasa el Zona de Convergencia Intertropical (ZCIT), en su oscilación migratoria Norte-Sur-Norte. Este hecho la convierte en la única isla oceánica con carácter pluvial en el Pacífico Tropical del Este, con muy altas precipitaciones anuales, lo cual constituye una característica excepcional en el contexto regional.

También, por su ubicación geográfica la Isla está bajo la influencia de un complejo sistema de corrientes marinas que, de manera excepcional, la exponen a recibir organismos del continente americano, así como de origen Indo-Pacífico, es decir, del Pacífico Central y del Oeste, y del Océano Índico. Por esta razón, su fauna y flora (biota) son una mezcla muy particular de elementos biológicos de diversos orígenes, y con un componente endémico desarrollado en la propia isla como consecuencia de su aislamiento.

Finalmente, por su ubicación geográfica esta Isla es un lugar idóneo para el estudio y monitoreo de los fenómenos climáticos y oceanográficos del Pacífico Tropical del Este, y de fenómenos globales como El Niño Oscilación Sur (ENOS).

Se puede concluir que la Isla del Coco es un verdadero laboratorio viviente, con una importancia científica que sobrepasa los límites de interés nacional y regional, y entra en la esfera del interés internacional y de la humanidad.